La humanidad después de casi 10000 años excluida de la Confederación Galáctica y confinada al abismo de Seth (sistema solar), es llevada nuevamente a ocupar su puesto en el consejo, reciben nuevamente su estatus de guardianes y se les advierte que sus enemigos siguen viviendo y que además deberán enfrentar una amenaza mortal: Vex'Raal, líder de una raza hostil y enemiga de la humanidad, los segadores, especie creada con el único fin de destruir humanos.
La humanidad debe demostrar que son inocentes de la destrucción de un planeta de seres luminosos y amantes de la paz, y que no son seres hostiles y pueden mantener el control sobre la galaxia sin destruirla.